双持，有日签，深圳人。准备先去纽约玩几天再回加拿大，美签上有加拿大pr的标注，所以不能在深圳口岸出示。于是买去日本的可退的机票酒店用于过关，去香港后再用红本护照换去纽约的登机牌。看了坛子上大佬关于iAPI的帖子，这样走在香港换登机牌和出境会不会有问题呢

不确定你担心的是什么。但是我看来：
1、有加拿大PR标注的美签可以从中国出发去美国，如果行程里不包括加拿大那么也不用出示加拿大枫叶卡，即使问起也可以说没带/过期待续等，不太可能因为没有枫叶卡而无法从中国去美国。
2、在香港换登机牌可以用红本也可用蓝本，在美国入境时也可以随意使用任一本护照，不一定是非要在香港check in时使用的护照。

10年美签呦，在这10年里难道不允许其中4年有加拿大PR另外6年没有加拿大PR么？所以觉得楼主有点多虑。