转: 中国科学院团队研究：华南海鲜市场并非新冠病毒发源地，11月下旬或已人传人
潇湘晨报网
中新社昆明 2 月 22 日电 据中国科学院西双版纳热带植物园官方网站消息，该园联合华南农业大学和北京脑科中心，收集了全球共享到 GISAID EpiFluTM 数据库中覆盖四大洲 12 个国家的 93 个新冠病毒样本基因组数据 ( 截至 2 月 12 日 ) ，通过全基因组数据解析发现：武汉华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其它地方传入。
93 个样本包含 58 种单倍型，演化关系显示，单倍型 H13 和 H38 是比较"古老的"单倍型，通过一个中间载体 ( mv1，可能是祖先单倍型，也可能是来自中间宿主或"零号病人" ) 与蝙蝠冠状病毒 RaTG13 关联，并通过单倍型 H3 衍生出单倍型 H1。
研究人员称，与华南海鲜市场有关联的患者样品单倍型都是 H1 及其衍生单倍型 H2，H8-H12，而一份武汉样品单倍型 H3 与华南海鲜市场无关。可见，华南海鲜市场的新冠病毒是从其它地方传入，再在市场发生快速传播并蔓延。另根据病患发病时间记录和种群扩张时间推断，也印证了华南海鲜市场不是病毒发源地的推论。
此外，研究人员对 H13 和 H38 的病毒样品溯源发现，分别来自深圳的病患 ( 广东首例 ) 和美国华盛顿州的病患 ( 美国首例 ) 。他们的旅行记录表明都是 2019 年 12 月底至 2020 年 1 月初在武汉被感染。现有武汉样本中没有检测到 H13 和 H38 单倍型。
研究还显示，新冠病毒在 2 月 12 日前发生过 2 次明显种群扩张：一次是 2019 年 12 月 8 日，该结果暗示病毒可能在 12 月初，甚至 11 月下旬已开始人际传播，随后在华南海鲜市场加快；另一次种群扩张发生在 1 月 6 日。
值得一提的是，为细分来源，研究人员将 58 种单倍型分成五组，包括 3 个古老超级传播者单倍型 ( H1,H3 和 H13 ) 和 2 个新的超级传播者单倍型 ( H56 和 mv2 ) 。以此鉴别出广东的病毒可能有三个来源，重庆和台湾的病毒有两个来源。有较多样本的澳大利亚、法国、日本和美国，患者感染源至少有两个，尤其是美国包括了五个来源。特别值得关注的是 H56 这个超级传播者单倍型，同时是澳大利亚、法国和美国以及中国台湾患者的传染源。
研究还表明，新冠病毒基因组没有发生重组事件。
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中新社昆明 2 月 22 日电 据中国科学院西双版纳热带植物园官方网站消息，该园联合华南农业大学和北京脑科中心，收集了全球共享到 GISAID EpiFluTM 数据库中覆盖四大洲 12 个国家的 93 个新冠病毒样本基因组数据 ( 截至 2 月 12 日 ) ，通过全基因组数据解析发现：武汉华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其它地方传入。
93 个样本包含 58 种单倍型，演化关系显示，单倍型 H13 和 H38 是比较"古老的"单倍型，通过一个中间载体 ( mv1，可能是祖先单倍型，也可能是来自中间宿主或"零号病人" ) 与蝙蝠冠状病毒 RaTG13 关联，并通过单倍型 H3 衍生出单倍型 H1。
研究人员称，与华南海鲜市场有关联的患者样品单倍型都是 H1 及其衍生单倍型 H2，H8-H12，而一份武汉样品单倍型 H3 与华南海鲜市场无关。可见，华南海鲜市场的新冠病毒是从其它地方传入，再在市场发生快速传播并蔓延。另根据病患发病时间记录和种群扩张时间推断，也印证了华南海鲜市场不是病毒发源地的推论。
此外，研究人员对 H13 和 H38 的病毒样品溯源发现，分别来自深圳的病患 ( 广东首例 ) 和美国华盛顿州的病患 ( 美国首例 ) 。他们的旅行记录表明都是 2019 年 12 月底至 2020 年 1 月初在武汉被感染。现有武汉样本中没有检测到 H13 和 H38 单倍型。
研究还显示，新冠病毒在 2 月 12 日前发生过 2 次明显种群扩张：一次是 2019 年 12 月 8 日，该结果暗示病毒可能在 12 月初，甚至 11 月下旬已开始人际传播，随后在华南海鲜市场加快；另一次种群扩张发生在 1 月 6 日。
值得一提的是，为细分来源，研究人员将 58 种单倍型分成五组，包括 3 个古老超级传播者单倍型 ( H1,H3 和 H13 ) 和 2 个新的超级传播者单倍型 ( H56 和 mv2 ) 。以此鉴别出广东的病毒可能有三个来源，重庆和台湾的病毒有两个来源。有较多样本的澳大利亚、法国、日本和美国，患者感染源至少有两个，尤其是美国包括了五个来源。特别值得关注的是 H56 这个超级传播者单倍型，同时是澳大利亚、法国和美国以及中国台湾患者的传染源。
研究还表明，新冠病毒基因组没有发生重组事件。
